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Das Social Genomics Lab besteht aus Wissenschaftlern verschiedener Fachrichtungen, wie Soziologie, Informatik, Bioinformatik, Statistik und Demografie, mit dem Ziel, die sozialen Korrelate von Genexpressionsprofilen zu untersuchen. Wir untersuchen Genexpressionsprofile, die die molekularen Grundlagen von Krankheiten und Alterung darstellen, und wie sozioökonomischer Status und Gesundheitsverhalten diese Profile vorhersagen. Unser Labor hat Zugang zu einem proprietären Datensatz, Add Health, der soziale Längsschnittdaten und Genexpressionsprofile von etwa 4.500 Personen im Alter zwischen 12 und 43 Jahren enthält. Darüber hinaus untersuchen wir die zehn häufigsten chronischen Erkrankungen des Alterns, wie Herz-Kreislauf-Erkrankungen und Typ-2-Diabetes, und planen, unsere Forschung auf Krebserkrankungen und Kopienzahlvarianten auszuweiten, die mit schweren neurologischen Entwicklungsstörungen in Verbindung gebracht werden. Das Labor hat auch Methoden entwickelt, um zu untersuchen, wann Risikofaktoren im Leben die Profile vorhersagen, und die daraus gewonnenen Erkenntnisse können politischen Entscheidungsträgern helfen, Gesundheitsmaßnahmen auf die wichtigsten Lebensabschnitte auszurichten.
Sudharshan Ravi, Michael J. Shanahan, Brandt Levitt, Kathleen Mullan Harris, Steven W. Cole. (In press). Socioeconomic inequalities in early adulthood disrupt the immune transcriptomic landscape via upstream regulators. Scientific Reports.
Julien Bodelet, Cecilia Potente, Guillaume Blanc, Justin Chumbley, Hira Imeri, Scott Hofer, Kathleen Harris, Graciela Muniz Terrera, Michael Shanahan. (In press). A Bayesian functional approach to test models of life course epidemiology over continuous time. International Journal of Epidemiology.
Shanahan, M., Cole, S., Ravi, S., Chumbley, J., Xu, W., Potente, C., Levitt, B., Bodelet, J., Aiello, A., Gaydosh, L., Harris, K. M. (2022). Socioeconomic inequalities in molecular risk for chronic diseases observed in young adulthood. PNAS 119. PDF (PDF, 1 MB)
Potente, C., Chumbley, J., Xu, W., Levitt, B., Cole, S. W., Ravi, S., Bodelet, J.S., Gaydosh, L. Harris, K. M., Shanahan, M. J. (in press). Socioeconomic inequalities characterize molecular risk for aging in young adulthood. American Journal of Epidemiology
Chumbley JR, Xu W, Potente C, Harris KM, Shanahan M. (2021). A Bayesian approach to comparing common models of life course epidemiology. International Journal of Epidemiology. 50(5): 1660-1670 PDF (PDF, 458 KB)
Potente, C, Harris, KM, Chumbley, J., Cole, SW, Gaydosh, L., Xu, W., Levitt, B., Shanahan, MJ. (2021). The early life course of body weight and gene expression signatures for disease. American Journal of Epidemiology. 190(8): 1533-1540 PDF (PDF, 219 KB)
Cole, SW, Shanahan, MJ, Gaydosh, L., & Harris, KM. (2020). Inflammatory and antiviral gene expression in Add Health: Molecular pathways to social disparities in disease emerge by young adulthood. PNAS, 117 (9), 4601-4608. PDF (PDF, 1 MB)
